Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Grik2P39087 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik2P39087 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik2P39087 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grik2P39087 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik2P39087 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik2P39087 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik2P39087 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik2P39087 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grik2P39087 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1373.9 ms