Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ddit3P35639 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddit3P35639 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddit3P35639 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms