Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PpardP35396 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PpardP35396 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PpardP35396 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PpardP35396 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PpardP35396 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PpardP35396 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PpardP35396 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PpardP35396 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PpardP35396 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PpardP35396 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PpardP35396 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PpardP35396 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PpardP35396 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PpardP35396 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PpardP35396 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PpardP35396 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PpardP35396 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PpardP35396 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PpardP35396 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PpardP35396 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PpardP35396 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PpardP35396 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PpardP35396 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PpardP35396 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PpardP35396 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PpardP35396 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PpardP35396 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PpardP35396 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PpardP35396 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PpardP35396 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PpardP35396 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PpardP35396 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PpardP35396 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PpardP35396 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PpardP35396 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PpardP35396 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PpardP35396 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PpardP35396 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PpardP35396 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PpardP35396 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PpardP35396 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PpardP35396 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PpardP35396 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PpardP35396 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PpardP35396 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PpardP35396 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PpardP35396 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PpardP35396 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PpardP35396 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PpardP35396 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PpardP35396 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PpardP35396 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PpardP35396 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PpardP35396 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PpardP35396 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PpardP35396 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PpardP35396 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PpardP35396 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PpardP35396 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PpardP35396 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PpardP35396 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PpardP35396 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PpardP35396 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PpardP35396 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PpardP35396 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PpardP35396 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PpardP35396 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PpardP35396 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PpardP35396 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PpardP35396 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PpardP35396 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PpardP35396 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PpardP35396 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PpardP35396 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PpardP35396 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PpardP35396 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PpardP35396 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PpardP35396 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PpardP35396 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PpardP35396 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PpardP35396 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PpardP35396 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PpardP35396 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PpardP35396 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PpardP35396 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PpardP35396 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PpardP35396 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PpardP35396 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PpardP35396 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PpardP35396 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PpardP35396 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PpardP35396 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PpardP35396 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PpardP35396 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PpardP35396 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PpardP35396 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PpardP35396 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PpardP35396 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PpardP35396 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms