Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab17P35292 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab17P35292 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab17P35292 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab17P35292 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab17P35292 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab17P35292 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab17P35292 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab17P35292 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab17P35292 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab17P35292 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab17P35292 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms