Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab23P35288 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab23P35288 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab23P35288 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab23P35288 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab23P35288 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab23P35288 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab23P35288 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab23P35288 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab23P35288 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab23P35288 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab23P35288 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab23P35288 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab23P35288 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab23P35288 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms