Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfap2aP34056 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tfap2aP34056 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms