Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Saa4P31532 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Saa4P31532 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Saa4P31532 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Saa4P31532 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Saa4P31532 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Saa4P31532 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Saa4P31532 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Saa4P31532 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Saa4P31532 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Saa4P31532 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Saa4P31532 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Saa4P31532 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms