Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc10P31257 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc10P31257 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms