Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrgP28705 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RxrgP28705 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RxrgP28705 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrgP28705 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RxrgP28705 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RxrgP28705 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RxrgP28705 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RxrgP28705 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RxrgP28705 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RxrgP28705 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RxrgP28705 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RxrgP28705 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RxrgP28705 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RxrgP28705 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RxrgP28705 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RxrgP28705 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RxrgP28705 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RxrgP28705 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RxrgP28705 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RxrgP28705 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RxrgP28705 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RxrgP28705 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RxrgP28705 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RxrgP28705 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RxrgP28705 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RxrgP28705 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RxrgP28705 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RxrgP28705 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RxrgP28705 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RxrgP28705 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RxrgP28705 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RxrgP28705 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RxrgP28705 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RxrgP28705 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RxrgP28705 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RxrgP28705 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RxrgP28705 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RxrgP28705 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RxrgP28705 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RxrgP28705 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RxrgP28705 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RxrgP28705 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RxrgP28705 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RxrgP28705 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RxrgP28705 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RxrgP28705 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RxrgP28705 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RxrgP28705 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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