Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Marcksl1P28667 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Marcksl1P28667 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Marcksl1P28667 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Marcksl1P28667 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.2 ms