Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NapbP28663 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NapbP28663 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NapbP28663 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NapbP28663 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NapbP28663 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NapbP28663 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NapbP28663 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NapbP28663 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NapbP28663 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NapbP28663 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NapbP28663 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NapbP28663 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NapbP28663 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NapbP28663 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NapbP28663 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NapbP28663 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NapbP28663 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NapbP28663 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NapbP28663 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NapbP28663 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NapbP28663 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NapbP28663 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NapbP28663 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NapbP28663 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NapbP28663 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NapbP28663 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NapbP28663 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NapbP28663 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NapbP28663 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NapbP28663 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NapbP28663 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NapbP28663 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NapbP28663 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NapbP28663 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NapbP28663 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NapbP28663 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NapbP28663 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NapbP28663 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NapbP28663 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NapbP28663 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NapbP28663 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NapbP28663 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NapbP28663 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NapbP28663 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NapbP28663 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NapbP28663 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NapbP28663 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NapbP28663 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NapbP28663 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NapbP28663 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NapbP28663 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NapbP28663 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NapbP28663 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NapbP28663 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NapbP28663 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NapbP28663 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NapbP28663 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NapbP28663 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NapbP28663 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NapbP28663 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NapbP28663 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NapbP28663 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NapbP28663 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NapbP28663 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NapbP28663 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NapbP28663 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NapbP28663 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NapbP28663 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NapbP28663 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NapbP28663 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NapbP28663 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NapbP28663 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NapbP28663 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NapbP28663 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NapbP28663 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NapbP28663 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NapbP28663 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NapbP28663 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NapbP28663 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NapbP28663 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NapbP28663 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NapbP28663 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NapbP28663 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NapbP28663 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NapbP28663 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NapbP28663 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NapbP28663 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NapbP28663 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NapbP28663 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NapbP28663 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NapbP28663 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NapbP28663 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NapbP28663 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NapbP28663 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NapbP28663 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NapbP28663 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NapbP28663 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NapbP28663 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NapbP28663 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms