Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn10P28658 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atxn10P28658 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn10P28658 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms