Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Twist1P26687 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Twist1P26687 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Twist1P26687 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Twist1P26687 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Twist1P26687 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Twist1P26687 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Twist1P26687 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Twist1P26687 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Twist1P26687 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Twist1P26687 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Twist1P26687 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Twist1P26687 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Twist1P26687 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms