Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Bmi1P25916 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bmi1P25916 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bmi1P25916 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms