Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo2P25801 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmo2P25801 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms