Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd247P24161 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd247P24161 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd247P24161 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd247P24161 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd247P24161 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd247P24161 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd247P24161 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd247P24161 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd247P24161 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms