Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd3eP22646 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd3eP22646 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms