Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RarbP22605 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RarbP22605 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RarbP22605 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RarbP22605 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RarbP22605 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RarbP22605 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RarbP22605 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RarbP22605 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RarbP22605 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RarbP22605 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RarbP22605 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RarbP22605 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RarbP22605 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RarbP22605 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RarbP22605 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RarbP22605 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RarbP22605 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RarbP22605 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RarbP22605 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RarbP22605 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RarbP22605 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RarbP22605 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RarbP22605 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RarbP22605 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RarbP22605 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RarbP22605 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RarbP22605 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RarbP22605 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RarbP22605 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RarbP22605 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RarbP22605 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RarbP22605 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RarbP22605 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RarbP22605 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RarbP22605 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RarbP22605 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RarbP22605 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RarbP22605 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RarbP22605 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RarbP22605 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RarbP22605 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RarbP22605 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RarbP22605 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RarbP22605 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RarbP22605 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RarbP22605 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RarbP22605 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RarbP22605 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RarbP22605 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RarbP22605 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RarbP22605 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RarbP22605 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RarbP22605 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RarbP22605 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RarbP22605 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RarbP22605 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RarbP22605 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RarbP22605 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RarbP22605 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RarbP22605 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RarbP22605 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RarbP22605 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RarbP22605 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RarbP22605 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RarbP22605 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RarbP22605 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RarbP22605 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RarbP22605 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RarbP22605 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RarbP22605 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RarbP22605 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RarbP22605 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RarbP22605 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RarbP22605 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RarbP22605 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RarbP22605 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RarbP22605 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RarbP22605 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RarbP22605 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RarbP22605 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RarbP22605 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RarbP22605 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RarbP22605 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RarbP22605 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RarbP22605 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RarbP22605 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RarbP22605 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RarbP22605 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RarbP22605 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RarbP22605 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RarbP22605 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RarbP22605 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RarbP22605 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RarbP22605 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RarbP22605 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RarbP22605 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RarbP22605 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RarbP22605 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RarbP22605 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms