Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcaP20444 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms