Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcna1P16388 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcna1P16388 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcna1P16388 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms