Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkceP16054 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkceP16054 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkceP16054 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkceP16054 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkceP16054 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkceP16054 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkceP16054 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkceP16054 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkceP16054 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkceP16054 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkceP16054 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkceP16054 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms