Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim30aP15533 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30aP15533 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms