Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calb1P12658 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calb1P12658 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calb1P12658 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calb1P12658 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Calb1P12658 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calb1P12658 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calb1P12658 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Calb1P12658 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calb1P12658 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calb1P12658 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calb1P12658 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb1P12658 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calb1P12658 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calb1P12658 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms