Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt8P11679 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt8P11679 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt8P11679 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt8P11679 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt8P11679 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt8P11679 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt8P11679 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt8P11679 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt8P11679 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt8P11679 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms