Protein–RNA interactions for Protein: P11627

L1cam, Neural cell adhesion molecule L1, mousemouse

Predictions only

Length 1,260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1camP11627 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1camP11627 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
L1camP11627 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1camP11627 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1camP11627 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1camP11627 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1camP11627 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1camP11627 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1camP11627 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1camP11627 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1camP11627 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1camP11627 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1camP11627 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1camP11627 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1camP11627 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1camP11627 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1camP11627 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1camP11627 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1camP11627 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1camP11627 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1camP11627 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
L1camP11627 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25■■□□□ 1.59
L1camP11627 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25■■□□□ 1.59
L1camP11627 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1camP11627 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1camP11627 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1camP11627 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1camP11627 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1camP11627 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1camP11627 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
L1camP11627 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1camP11627 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1camP11627 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1camP11627 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1camP11627 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1camP11627 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1camP11627 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1camP11627 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1camP11627 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1camP11627 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
L1camP11627 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
L1camP11627 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
L1camP11627 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
L1camP11627 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
L1camP11627 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1camP11627 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1camP11627 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1camP11627 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
L1camP11627 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
L1camP11627 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1camP11627 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1camP11627 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1camP11627 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1camP11627 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1camP11627 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1camP11627 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1camP11627 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1camP11627 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1camP11627 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1camP11627 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1camP11627 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1camP11627 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1camP11627 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
L1camP11627 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
L1camP11627 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
L1camP11627 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
L1camP11627 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
L1camP11627 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
L1camP11627 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1camP11627 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1camP11627 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1camP11627 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1camP11627 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
L1camP11627 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
L1camP11627 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1camP11627 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1camP11627 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1camP11627 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1camP11627 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1camP11627 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1camP11627 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1camP11627 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1camP11627 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1camP11627 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1camP11627 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1camP11627 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1camP11627 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1camP11627 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1camP11627 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1camP11627 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1camP11627 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1camP11627 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1camP11627 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1camP11627 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1camP11627 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1camP11627 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1camP11627 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1camP11627 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1camP11627 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1camP11627 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms