Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl2P10889 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl2P10889 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl2P10889 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl2P10889 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl2P10889 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl2P10889 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl2P10889 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl2P10889 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxcl2P10889 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms