Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P10404 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P10404 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P10404 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P10404 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P10404 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P10404 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P10404 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P10404 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P10404 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P10404 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P10404 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P10404 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P10404 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P10404 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P10404 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P10404 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P10404 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P10404 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P10404 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P10404 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P10404 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P10404 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P10404 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P10404 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P10404 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P10404 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P10404 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P10404 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P10404 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P10404 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P10404 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P10404 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P10404 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P10404 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P10404 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P10404 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P10404 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P10404 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P10404 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P10404 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P10404 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P10404 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P10404 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P10404 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P10404 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P10404 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P10404 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P10404 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P10404 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P10404 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P10404 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P10404 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P10404 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P10404 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P10404 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P10404 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P10404 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P10404 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P10404 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P10404 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P10404 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P10404 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P10404 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P10404 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P10404 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P10404 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P10404 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P10404 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P10404 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P10404 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P10404 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P10404 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms