Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxb8P09632 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxb8P09632 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb8P09632 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms