Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna5P07349 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna5P07349 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna5P07349 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna5P07349 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna5P07349 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna5P07349 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna5P07349 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna5P07349 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms