Protein–RNA interactions for Protein: P06327

Gm5629, Ig heavy chain V region VH558 A1/A4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5629P06327 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5629P06327 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5629P06327 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms