Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PdgfrbP05622 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfrbP05622 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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