Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XlrP05531 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XlrP05531 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XlrP05531 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XlrP05531 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XlrP05531 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XlrP05531 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XlrP05531 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XlrP05531 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XlrP05531 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XlrP05531 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XlrP05531 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XlrP05531 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XlrP05531 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XlrP05531 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XlrP05531 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XlrP05531 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XlrP05531 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XlrP05531 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XlrP05531 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XlrP05531 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XlrP05531 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XlrP05531 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XlrP05531 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XlrP05531 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XlrP05531 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XlrP05531 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XlrP05531 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XlrP05531 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XlrP05531 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XlrP05531 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XlrP05531 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XlrP05531 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XlrP05531 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XlrP05531 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XlrP05531 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XlrP05531 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XlrP05531 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XlrP05531 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XlrP05531 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XlrP05531 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XlrP05531 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XlrP05531 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XlrP05531 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XlrP05531 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XlrP05531 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XlrP05531 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XlrP05531 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XlrP05531 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XlrP05531 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XlrP05531 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XlrP05531 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XlrP05531 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XlrP05531 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XlrP05531 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XlrP05531 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XlrP05531 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XlrP05531 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XlrP05531 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XlrP05531 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XlrP05531 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XlrP05531 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XlrP05531 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XlrP05531 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XlrP05531 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XlrP05531 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XlrP05531 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XlrP05531 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XlrP05531 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XlrP05531 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
XlrP05531 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XlrP05531 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XlrP05531 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XlrP05531 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XlrP05531 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XlrP05531 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XlrP05531 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XlrP05531 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XlrP05531 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XlrP05531 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XlrP05531 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XlrP05531 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XlrP05531 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XlrP05531 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XlrP05531 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XlrP05531 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XlrP05531 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XlrP05531 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XlrP05531 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XlrP05531 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XlrP05531 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XlrP05531 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XlrP05531 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XlrP05531 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XlrP05531 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XlrP05531 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XlrP05531 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XlrP05531 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XlrP05531 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XlrP05531 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms