Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-Eb1P04230 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Eb1P04230 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb1P04230 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb1P04230 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms