Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tk1P04184 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tk1P04184 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tk1P04184 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tk1P04184 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tk1P04184 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tk1P04184 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tk1P04184 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tk1P04184 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tk1P04184 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tk1P04184 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tk1P04184 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tk1P04184 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tk1P04184 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tk1P04184 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms