Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
P01915 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01915 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01915 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01915 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01915 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01915 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01915 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01915 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01915 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01915 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01915 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01915 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01915 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01915 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01915 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01915 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01915 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01915 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01915 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01915 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01915 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01915 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01915 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01915 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01915 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01915 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01915 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01915 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01915 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01915 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01915 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01915 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01915 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01915 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01915 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01915 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01915 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01915 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01915 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01915 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01915 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01915 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01915 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01915 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01915 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01915 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01915 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01915 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01915 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01915 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01915 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01915 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01915 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01915 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01915 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01915 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01915 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01915 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01915 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01915 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01915 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01915 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01915 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01915 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01915 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01915 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01915 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01915 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01915 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01915 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01915 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
P01915 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01915 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01915 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms