Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01896 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01896 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01896 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01896 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01896 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01896 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01896 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01896 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01896 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01896 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01896 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01896 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01896 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01896 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01896 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01896 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01896 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01896 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01896 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01896 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01896 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01896 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01896 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01896 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01896 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01896 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01896 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01896 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01896 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01896 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01896 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01896 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01896 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01896 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01896 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01896 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01896 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01896 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01896 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01896 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01896 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01896 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01896 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01896 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01896 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01896 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01896 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01896 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01896 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01896 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01896 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01896 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01896 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01896 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01896 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01896 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01896 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01896 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01896 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01896 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01896 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01896 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01896 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01896 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01896 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01896 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01896 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01896 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01896 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01896 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01896 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01896 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01896 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01896 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01896 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01896 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01896 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01896 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01896 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01896 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01896 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01896 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01896 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01896 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01896 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01896 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01896 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01896 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01896 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01896 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01896 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01896 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01896 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01896 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01896 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01896 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01896 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01896 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01896 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms