Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01823 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01823 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01823 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01823 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01823 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01823 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01823 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01823 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01823 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01823 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01823 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01823 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01823 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01823 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01823 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01823 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01823 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01823 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01823 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01823 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01823 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01823 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01823 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01823 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01823 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01823 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01823 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01823 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01823 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01823 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01823 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01823 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01823 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01823 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01823 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01823 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01823 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01823 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01823 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01823 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01823 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01823 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01823 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01823 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01823 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01823 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01823 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01823 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01823 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01823 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01823 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01823 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01823 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01823 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01823 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01823 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01823 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01823 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01823 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01823 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01823 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01823 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01823 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01823 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01823 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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