Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01729 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01729 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01729 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01729 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01729 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01729 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01729 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01729 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01729 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01729 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01729 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01729 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01729 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01729 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01729 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01729 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01729 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01729 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01729 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01729 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01729 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01729 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01729 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01729 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01729 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01729 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01729 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01729 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01729 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01729 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01729 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01729 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01729 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01729 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01729 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01729 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01729 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01729 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01729 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01729 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01729 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01729 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01729 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01729 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01729 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01729 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01729 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01729 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01729 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01729 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01729 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01729 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01729 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01729 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01729 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01729 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01729 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01729 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01729 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01729 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01729 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01729 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01729 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01729 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01729 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01729 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01729 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01729 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01729 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01729 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01729 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01729 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01729 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01729 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01729 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01729 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01729 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01729 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01729 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01729 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01729 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
P01729 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01729 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01729 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01729 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01729 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01729 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms