Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01649 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01649 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01649 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01649 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01649 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01649 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01649 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01649 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01649 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01649 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01649 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01649 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01649 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01649 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01649 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01649 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01649 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01649 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01649 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01649 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01649 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01649 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01649 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01649 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01649 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01649 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01649 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01649 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01649 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01649 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01649 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01649 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01649 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01649 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01649 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01649 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01649 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01649 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01649 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01649 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01649 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01649 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01649 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01649 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01649 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01649 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01649 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01649 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01649 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01649 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01649 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01649 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01649 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01649 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01649 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01649 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01649 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01649 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01649 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01649 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01649 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01649 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01649 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
P01649 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
P01649 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01649 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01649 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01649 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01649 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01649 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01649 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01649 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01649 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01649 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01649 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01649 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01649 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01649 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01649 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01649 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01649 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01649 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01649 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01649 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01649 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01649 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01649 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
P01649 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01649 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
P01649 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01649 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01649 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01649 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01649 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01649 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01649 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01649 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01649 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01649 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms