Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifna1P01572 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifna1P01572 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifna1P01572 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms