Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apaf1O88879 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apaf1O88879 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Apaf1O88879 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms