Protein–RNA interactions for Protein: O88712

Ctbp1, C-terminal-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp1O88712 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp1O88712 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp1O88712 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp1O88712 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp1O88712 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp1O88712 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp1O88712 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp1O88712 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp1O88712 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp1O88712 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp1O88712 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp1O88712 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctbp1O88712 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctbp1O88712 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctbp1O88712 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms