Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd2O70572 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smpd2O70572 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpd2O70572 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd2O70572 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd2O70572 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd2O70572 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd2O70572 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd2O70572 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpd2O70572 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpd2O70572 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpd2O70572 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpd2O70572 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms