Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtssO70370 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CtssO70370 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtssO70370 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtssO70370 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtssO70370 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtssO70370 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtssO70370 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtssO70370 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtssO70370 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtssO70370 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtssO70370 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtssO70370 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtssO70370 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtssO70370 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtssO70370 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CtssO70370 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtssO70370 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtssO70370 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtssO70370 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtssO70370 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtssO70370 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtssO70370 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtssO70370 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtssO70370 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtssO70370 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtssO70370 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtssO70370 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtssO70370 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CtssO70370 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtssO70370 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtssO70370 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtssO70370 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtssO70370 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtssO70370 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtssO70370 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CtssO70370 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtssO70370 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtssO70370 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtssO70370 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtssO70370 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtssO70370 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtssO70370 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtssO70370 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtssO70370 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtssO70370 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtssO70370 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtssO70370 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtssO70370 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtssO70370 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtssO70370 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtssO70370 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtssO70370 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtssO70370 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtssO70370 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtssO70370 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtssO70370 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtssO70370 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtssO70370 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtssO70370 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CtssO70370 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtssO70370 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtssO70370 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtssO70370 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtssO70370 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtssO70370 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtssO70370 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtssO70370 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CtssO70370 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtssO70370 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtssO70370 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtssO70370 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtssO70370 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtssO70370 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtssO70370 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtssO70370 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtssO70370 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtssO70370 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtssO70370 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtssO70370 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtssO70370 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CtssO70370 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtssO70370 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtssO70370 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CtssO70370 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtssO70370 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtssO70370 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtssO70370 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtssO70370 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtssO70370 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtssO70370 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtssO70370 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtssO70370 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtssO70370 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtssO70370 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtssO70370 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtssO70370 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtssO70370 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtssO70370 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CtssO70370 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms