Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Foxq1O70220 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxq1O70220 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxq1O70220 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms