Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf5O70191 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf5O70191 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf5O70191 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atf5O70191 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atf5O70191 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atf5O70191 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf5O70191 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf5O70191 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf5O70191 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf5O70191 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf5O70191 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf5O70191 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms