Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp10O55123 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp10O55123 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mmp10O55123 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp10O55123 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms