Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnk2O54967 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnk2O54967 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnk2O54967 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms