Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarce1O54941 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarce1O54941 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarce1O54941 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms