Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb3O54890 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Itgb3O54890 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb3O54890 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms